基因测序技术存在试剂耗材费用高、单次检测需要72小时、步骤繁杂、关键时间节点多、计算复杂、存在人为不确定影响因素多等特点，且单次样品检测固定费用超过3万元。

根据最新“乙类乙管”防控要求，各级医疗医疗机构发现的核酸阳性且CT值≤32的标本，市级疾控机构必须在24小时内开展基因测序工作。当前，各市州普遍存在需要测序的样品数量少，且阳性出现时间不确定，导致检测成本过高，人力投入过大。为有效降低基因测序成本，减少重复劳动，鄂州市疾控中心积极谋划，主动与黄石、黄冈、咸宁及孝感市疾控中心对接，建立基因测序联动协作网上平台，适时收集鄂东南各市阳性样本信息，轮流进行测序工作，不仅可以有效减少不必要的重复劳动，还可以将单个样品的测序成本降至3000元以下。

2022年7月，鄂州市疾控中心在鄂东南首家开展基因测序工作。今年以来，共对52份样品进行基因测序，检测结果的准确率和及时率均达到100％，为发现新的变异株、疫情研判、疫情溯源和疫情防控部署提供依据和方向。下一步，鄂州市疾控中心将细化优化协作机制，在节省成本、减少工作量的同时，争取在最短的时间出结果，为减少疫情传播、有效防控新冠疫情作出新的贡献。